Setelah dilakukan transplantasi, pasien akan dirawat di ruang rawat intensif (ICU) khusus transplantasi paru. Bila kondisi sudah stabil, pasien kemudian dipindahkan ke ruang rawat biasa yang didedikasikan khusus untuk pasien pasca transplantasi paru.

Selama perawatan, rehabilitasi dilakukan untuk mempercepat pemulihan pasca transplantasi. Rehabilitasi dan fisioterapi dilakukan oleh tim dokter spesialis rehabilitasi medis dengan menggunakan alat-alat yang mendukung proses rehabilitasi.